>>304
>TestSampleVCL_Originalが存在することで偶然パスが通っているに過ぎないミス

と言われてもDelphiが勝手にやってることだし

TestSampleVCL_Originalフォルダ内の元のdprojは
<Icon_MainIcon>Icons\app-icon.ico</Icon_MainIcon>となってる

これをプロジェクトの別名保存を実行した段階で
（たぶんDelphiが気を利かせて）
TestSampleVCL_Movedフォルダ内の新しいdprojでは
<Icon_MainIcon>..\TestSampleVCL_Original\Icons\app-icon.ico</Icon_MainIcon>
とDelphiが自動で修正したということ

「プロジェクトに名前を付けて保存」で
すべてコピーされたと勘違いして元のフォルダを削除すると
ソースが失われる危険性があるのが怖い