アドバイスでもなんでもないが俺も昔自分用のファイルDB作ってたんだが
起動時に対象フォルダ下のファイルをGetFilesやGetDirectoriesで収集 → DBからタグ等の細かい情報取ってきてくっ付けるってやるとき、sqliteから一つ一つwhere fullpathというように文字列で検索すると約5000件/3分くらいかかったんだよな
そこでwhereを入れず全部取得　→ while (reader.Read()) sqFiles.Add();と一旦こちらのリストに全部放り込んでから
愚直にforでリストからフルパスと一致するものを探すって方式に変えたら5000件/500msというアホみたいに高速化された思い出がある