Q. システムコールとC言語のインターフェースはなぜ異なるのですか？

A. システムコールは関数呼び出しではなくシステムコール用のCPU命令や割り込み命令を使います。
引数や戻り値に使われるレジスタやメモリの使用方法も同じとは限りません。
通常の引数とは別にシステムコール番号をレジスタに指定する必要もあります。
その他に退避させるべきレジスタの決まりが異なる場合もあります。
以上の理由によりシステムコールとC言語のインターフェースは異なります。