https://www.virustotal.com/ 自体はまっとうな正規だよ。
VPS → https://www.virustotal.com/en/ip_address/（ここにIP）/infomation の通信があったとして、何の問題があるんだ？
VPS から外部のオンラインウイルススキャンサービスを利用しちゃいけないわけないし。

> この度、お客様のご利用領域から外部の問題のあると思われる
> サーバーとの通信を確認いたしました。

ということは、お名前にとって www.virustotal.com が「外部の問題のあると思われるサーバー」なのか？
そのウイルススキャンサービス、Google が買収したから今 Google 運営なんだけど。。。

上記の話を見た限り、お名前の対応がおかしい気がする


それとも、VPS から www.virustotal.com への異常な大量アクセス（DoS攻撃）が行われたって意味？