マジレスするとコンピューターを使いこなせる人をハッカーというんだよ。
ハッカーの元の使い方はこれです。

しかし高度コンピューター時代になりコンピューターを使う犯罪が増えてきました。
ニュースなどでハッカーハッカーと取り上げられているうちに
ハッカー＝悪いやつとなってしまったわけです。

今でもハッカー＝アングラなどと結びつける雑誌やテレビなどが一番の大きな原因でしょうね。